Bio-Chado-Schema

Changes for version 0.06300 - 2010-10-18

converted build system to Dist::Zilla
applied nmenda's type_id corrections from chado trunk
fix permission denied test failure caused by shipping a t/var/BCS.db file by accident

Documentation

Bio::Chado::Schema::CellLine

Bio::Chado::Schema::Companalysis

Bio::Chado::Schema::Composite

Bio::Chado::Schema::Contact

Bio::Chado::Schema::Cv

Bio::Chado::Schema::Expression

Bio::Chado::Schema::General

Bio::Chado::Schema::Genetic

Bio::Chado::Schema::Library

Bio::Chado::Schema::Mage

Bio::Chado::Schema::Map

Bio::Chado::Schema::NaturalDiversity

Bio::Chado::Schema::Organism

Bio::Chado::Schema::Phenotype

Bio::Chado::Schema::Phylogeny

Bio::Chado::Schema::Project

Bio::Chado::Schema::Pub

Bio::Chado::Schema::Sequence

Bio::Chado::Schema::Stock

Bio::Chado::Schema::Util

update_dbic_dump.pl

developer-only maintenance script to sync this DBIx::Class object layer with the latest upstream version of Chado

Modules

Bio::Chado::Schema

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLine

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineCvterm

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineCvtermprop

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineDbxref

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineFeature

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineLibrary

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLinePub

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineRelationship

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineSynonym

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineprop

Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLinepropPub

Bio::Chado::Schema::Companalysis::Analysis

Bio::Chado::Schema::Companalysis::Analysisfeature

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Bio::Chado::Schema::Companalysis::Analysisprop

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Bio::Chado::Schema::Composite::FLoc

Bio::Chado::Schema::Composite::FType

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Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureMeetsOnSameStrand

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Bio::Chado::Schema::Composite::FeaturesetMeets

Bio::Chado::Schema::Composite::FnrType

Bio::Chado::Schema::Composite::FpKey

Bio::Chado::Schema::Composite::Gff3atts

Bio::Chado::Schema::Composite::Gff3view

Bio::Chado::Schema::Composite::Gffatts

Bio::Chado::Schema::Contact::Contact

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Bio::Chado::Schema::Cv::CommonDescendantCvterm

Bio::Chado::Schema::Cv::Cv

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Bio::Chado::Schema::Expression::Expression

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Bio::Chado::Schema::Expression::ExpressionImage

Bio::Chado::Schema::Expression::ExpressionPub

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Bio::Chado::Schema::General::Tableinfo

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Bio::Chado::Schema::Library::Library

Bio::Chado::Schema::Library::LibraryCvterm

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Bio::Chado::Schema::Library::LibraryPub

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Bio::Chado::Schema::Mage::AcquisitionRelationship

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Bio::Chado::Schema::Mage::Arraydesignprop

Bio::Chado::Schema::Mage::Assay

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Bio::Chado::Schema::Mage::Channel

Bio::Chado::Schema::Mage::Control

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Bio::Chado::Schema::Mage::ElementRelationship

Bio::Chado::Schema::Mage::Elementresult

Bio::Chado::Schema::Mage::ElementresultRelationship

Bio::Chado::Schema::Mage::Magedocumentation

Bio::Chado::Schema::Mage::Mageml

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Bio::Chado::Schema::Mage::Protocolparam

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Bio::Chado::Schema::Mage::StudyAssay

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Bio::Chado::Schema::Mage::Studyfactorvalue

Bio::Chado::Schema::Mage::Studyprop

Bio::Chado::Schema::Mage::StudypropFeature

Bio::Chado::Schema::Mage::Treatment

Bio::Chado::Schema::Map::Featuremap

Bio::Chado::Schema::Map::FeaturemapPub

Bio::Chado::Schema::Map::Featurepos

Bio::Chado::Schema::Map::Featurerange

Bio::Chado::Schema::NaturalDiversity::NdExperiment

Bio::Chado::Schema::NaturalDiversity::NdExperimentContact

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Bio::Chado::Schema::NaturalDiversity::NdExperimentGenotype

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Bio::Chado::Schema::NaturalDiversity::NdExperimentProject

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Bio::Chado::Schema::Project::ProjectPub

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Bio::Chado::Schema::Pub::Pub

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Bio::Chado::Schema::Pub::PubRelationship

Bio::Chado::Schema::Pub::Pubauthor

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Bio::Chado::Schema::Sequence::IntronlocView

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Bio::Chado::Schema::Stock::StockRelationship

Bio::Chado::Schema::Stock::StockRelationshipCvterm

Bio::Chado::Schema::Stock::StockRelationshipPub

Bio::Chado::Schema::Stock::Stockcollection

Bio::Chado::Schema::Stock::StockcollectionStock

Bio::Chado::Schema::Stock::Stockcollectionprop

Bio::Chado::Schema::Stock::Stockprop

Bio::Chado::Schema::Stock::StockpropPub

Provides

Bio::Chado::Schema::Cv::Cvterm::ResultSet

in lib/Bio/Chado/Schema/Cv/Cvterm.pm

Bio::Chado::Schema::Util

in lib/Bio/Chado/Schema.pm

Other files

To install Bio::Chado::Schema, copy and paste the appropriate command in to your terminal.

cpanm

cpanm Bio::Chado::Schema

CPAN shell

perl -MCPAN -e shell
install Bio::Chado::Schema

For more information on module installation, please visit the detailed CPAN module installation guide.

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`g` `b`	Go to file browse

	Search terms
module: (e.g. module:Plugin)
distribution: (e.g. distribution:Dancer auth)
author: (e.g. author:SONGMU Redis)
version: (e.g. version:1.00)

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Provides

Other files

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